30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2004 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  58.43 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  53.38 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  54.51 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  54.37 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  36.19 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  36.19 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  35.8 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  34.09 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  36.03 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  35.48 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  35.48 
 
 		 247 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  35.22 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  33.61 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  30.83 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  26.89 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2074  hypothetical protein  26.02 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000228759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2560  hypothetical protein  27.69 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3496  hypothetical protein  26.88 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2145  hypothetical protein  26.53 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000019713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  25.9 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  23.35 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>