203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1412 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 353 aa  722    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  74.14 
 
 		 352 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  73.2 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  69.6 
 
 		 355 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  67.91 
 
 		 353 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  66.57 
 
 		 358 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  65.62 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  39.3 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  34.78 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  35.8 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3649  hypothetical protein  34.64 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  34.97 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  30.97 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  33.44 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  31.34 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  30.15 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  34.45 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  34.76 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  33.65 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  32.92 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  32.05 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  33.55 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  31.43 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  31.45 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  30.94 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  33.44 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  31.23 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  29.73 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  29.88 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  30.13 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4381  phosphoesterase RecJ domain protein  30.79 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  33.12 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  32.89 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  29.13 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  31.23 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  32.22 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  35.45 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  30.94 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  31.49 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  31.04 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  29.54 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  31.14 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  34.2 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  36.94 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0965  phosphoesterase domain-containing protein  31.67 
 
 		 319 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0127219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  30.67 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1671  phosphoesterase RecJ domain protein  31.61 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00108699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  31.96 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  30.06 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  31.96 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.11 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  31.41 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  32.62 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  28.66 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.84 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  29.56 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  28.04 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  29.22 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  28.05 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  28.35 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  30.09 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3328  phosphoesterase RecJ domain protein  31.13 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.506881  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  28.06 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  29.7 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2816  phosphoesterase domain-containing protein  30.21 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  29.85 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  30.23 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  25.53 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  25.15 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.23 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  24.84 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  24.84 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  27.5 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  30.03 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  28.53 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  31.1 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  26.97 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  28.83 
 
 		 333 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  29.45 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  28.57 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  28.06 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  25.44 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1373  phosphoesterase domain-containing protein  28.31 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796357  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  29.55 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  28.7 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  26.73 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.371885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  26.96 
 
 		 310 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  24.32 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1414  phosphoesterase, RecJ-like protein  30.25 
 
 		 322 aa  95.9  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  24.92 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0828  phosphoesterase RecJ domain protein  25 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.637803  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0637  DHH family protein  28.34 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000263818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4037  phosphoesterase domain-containing protein  29.21 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.458843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  27.52 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  27.18 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  27.18 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  29.55 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  27.18 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>