39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1320 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 290 aa  591  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  66.94 
 
 		 268 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  52.08 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  51.35 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  45.1 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.82 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  38.78 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  45.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  45.24 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  38.98 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  48.48 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0261  hypothetical protein  22.35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  42.55 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  44.23 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  43.14 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 356 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  43.14 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  43.14 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 208 aa  45.8  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  37.5 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  46.67 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  51.02 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  45.45 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  51.16 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  40.43 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  43.9 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 350 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  37.74 
 
 		 220 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  40.48 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  41.27 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  43.18 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  38.3 
 
 		 79 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  44.68 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  40 
 
 		 247 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>