23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0396 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  338  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  48.15 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  46.27 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  34.27 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  49.4 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  36.05 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  31.2 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  31.58 
 
 		 438 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  31.91 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  29.17 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  30.66 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  32.62 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  27.69 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  26.92 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  28.46 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  28.46 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  29.37 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  30.48 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>