68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0596 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0596  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2235  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000206956  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1310  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000178141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2189  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463741  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0014  tRNA-Arg  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0644  tRNA-Arg  94 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1441  tRNA-Arg  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1721  tRNA-Arg  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.422722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0144  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0778877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0125  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0119  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289401  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0133  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000540924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00108542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0145  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00165152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00382598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13660  tRNA-Met  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0986692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t100  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0137  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000570395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000206641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.75632  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0798313  hitchhiker  0.000168441 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0777  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0772068  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1745  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA30  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.179401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60470  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60460  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4607  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0229671  normal  0.529738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0382605  normal  0.525987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387669  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0078  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0079  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0080  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0081  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.35355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t65  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247556  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t66  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.190236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t67  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.19275 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.574082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52540  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000136889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52550  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000730031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.477041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0180356  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0100237  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00997597  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0174897  normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t64  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4608  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0144  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>