111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE_tRNA-Arg-3 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.75632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1745  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0777  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0772068  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0586  tRNA-Arg  97.06 
 
 		 74 bp  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00782572  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1052  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.270122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2240  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0800  tRNA-Arg  97.96 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000572817  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2167  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0053  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902576 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_R0064  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0036  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4582  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0034  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0041  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.707776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0124116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0033    96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.465257  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0030  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54758  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0048  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.480879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0036  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA24  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0036  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0056  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.159336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0053  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0490  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0049  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2189  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2235  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000206956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0030  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2016  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0026  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0596  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000852456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t64  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t65  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247556  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t67  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.19275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t100  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0019  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000206641  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0064  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0137  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000570395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0018  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.574082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52540  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000136889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52550  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000730031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00382598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0125  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0119  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.35355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.477041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0075  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0180356  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00997597  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0174897  normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4607  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4608  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0133  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0235921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0144  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0778877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0078  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0080  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0081  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0229671  normal  0.529738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387669  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0054  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0462421  normal  0.0117618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t003  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>