21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1441 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1441  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1721  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.422722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2189  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1310  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000178141  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0644  tRNA-Arg  98.31 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2235  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000206956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0014  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0596  tRNA-Arg  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0054  tRNA-Arg  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0020  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0037  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0828388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0038  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.903722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.464921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0059  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>