33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0644 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0644  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2189  tRNA-Arg  96 
 
 		 79 bp  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  98.31 
 
 		 77 bp  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1441  tRNA-Arg  98.31 
 
 		 77 bp  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1721  tRNA-Arg  98.31 
 
 		 77 bp  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.422722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1310  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000178141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2235  tRNA-Arg  92 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000206956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0014  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0596  tRNA-Arg  94 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000852456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0144  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0778877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00108542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0145  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00165152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000206641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0133  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t100  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0119  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000540924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0125  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0137  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000570395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00382598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.500837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0798313  hitchhiker  0.000168441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2513  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0504098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA30  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.179401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>