17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0014 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1310  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000178141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2235  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000206956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2189  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1441  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1721  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.422722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0596  tRNA-Arg  95.74 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0644  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0054  tRNA-Arg  87.88 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0024  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.189298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>