299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_60460  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60470  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4607  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 79 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4608  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 79 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52540  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000136889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52550  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000730031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0062  tRNA-Arg  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0382605  normal  0.525987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0055  tRNA-Arg  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.35355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0057  tRNA-Arg  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.477041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0056  tRNA-Arg  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0061  tRNA-Arg  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387669  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0060  tRNA-Arg  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0229671  normal  0.529738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0032  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000000959667  hitchhiker  0.000000184359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0033  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000000989089  hitchhiker  0.000000187965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0034  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269969  hitchhiker  0.000000184359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t64  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t65  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247556  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t66  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.190236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t67  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.19275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0045  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0174897  normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0043  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0100237  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0078  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5059  tRNA-Arg  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0042  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0180356  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0081  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0044  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00997597  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0080  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0079  tRNA-Arg  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00046  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00171034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00047  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000114656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00048  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00049  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00002117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0021  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.81714e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0022  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0023  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0024  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000881363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  0.0000634029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0051  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000808669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03502  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3303  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.00797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3311  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.02853e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3025  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000605333  hitchhiker  0.0000124433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3026  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000587212  decreased coverage  0.00000637793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5061  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000841029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2814  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233907  hitchhiker  0.000209563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2813  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000234926  hitchhiker  0.000405457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2816  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178487  hitchhiker  0.000205379 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2815  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206258  hitchhiker  0.000196264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0050  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000319175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5060  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000763058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0070  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03499  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5062  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000187047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3023  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00222137  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0073  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000674469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3008  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  hitchhiker  0.0000193461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3007  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0130916  hitchhiker  0.0000187167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3009  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00101658  hitchhiker  0.0000207447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3010  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000160171  hitchhiker  0.0000213321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2972  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000972805  decreased coverage  0.000049026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2973  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000185048  decreased coverage  0.0000513865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0026  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000629117  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0025  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000117209  hitchhiker  0.00392974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0028  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000113112  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0027  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000577266  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0072  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000163707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03501  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03500  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03506  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03504  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4689  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.97253e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4688  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4691  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.89876e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4690  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.01882e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0055  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000268811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3024  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000763539  hitchhiker  0.0000122592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0071  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000014957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000305181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0040  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409626  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>