28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10730  ABC-2 type transporter  100 
 
 
393 aa  787    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0561  hypothetical protein  37.28 
 
 
411 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0637  multidrug ABC transporter permease  25.75 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1223  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
386 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0696  hypothetical protein  22.75 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1307  ABC-2 type transporter  20.06 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  21.19 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  19.55 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  19.44 
 
 
380 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  19.44 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  19.44 
 
 
380 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  21.45 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  18.93 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  19.44 
 
 
381 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  22.75 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  19.15 
 
 
381 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  20.8 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  42.55 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  21.41 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  22.65 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.33 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  18.51 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0382  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
267 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>