268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5440 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
72 aa  150  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  75.93 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  73.58 
 
 
172 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  71.7 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  70.49 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  64.81 
 
 
55 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.41 
 
 
57 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
54 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.41 
 
 
57 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  61.54 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  57.14 
 
 
470 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
53 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
53 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
53 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
53 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  51.02 
 
 
481 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
455 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  51.22 
 
 
229 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  52 
 
 
54 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
54 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.02 
 
 
476 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
55 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  50 
 
 
55 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  50 
 
 
55 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  50 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  50 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
469 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.93 
 
 
445 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  50.98 
 
 
56 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  43.14 
 
 
57 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
55 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
55 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.44 
 
 
480 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  48 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
55 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  42.59 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
55 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
444 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
55 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  46.51 
 
 
58 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
54 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
62 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
56 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
444 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0604584  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  50 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
444 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  44 
 
 
477 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
54 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  44 
 
 
461 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
58 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.7 
 
 
235 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5474  rubredoxin  44 
 
 
55 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.62 
 
 
485 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
52 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
415 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.42 
 
 
479 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.42 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.42 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.42 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.71 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  35.42 
 
 
479 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.71 
 
 
479 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.71 
 
 
479 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.58 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
54 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  44 
 
 
238 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.62 
 
 
589 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  41.67 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  46.34 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  46.34 
 
 
58 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.89 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2245  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.91 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0270478  normal  0.0358856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
63 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  41.67 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.54 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.67 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>