64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4122 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4122  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  8.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0288564  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4118  helicase domain-containing protein  99.24 
 
 		 851 aa  265  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0074  helicase-like  69.34 
 
 		 1066 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2292  helicase domain-containing protein  76.23 
 
 		 925 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.94626  normal  0.593111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1698  helicase domain-containing protein  73.77 
 
 		 997 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3311  helicase-like  66.41 
 
 		 978 aa  187  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505804  normal  0.0528841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3088  helicase domain-containing protein  70.31 
 
 		 837 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0253  helicase domain protein  67.44 
 
 		 890 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0573  helicase-like  69.42 
 
 		 984 aa  183  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.013088  hitchhiker  0.00000121316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1131  helicase domain-containing protein  70.97 
 
 		 1027 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0783  helicase domain protein  68.29 
 
 		 987 aa  180  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000205991  normal  0.0820229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0545  helicase-like  66.15 
 
 		 1169 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2739  helicase-like protein  68.33 
 
 		 920 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3540  helicase domain-containing protein  62.41 
 
 		 865 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420075  normal  0.672772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1828  helicase domain-containing protein  62.68 
 
 		 975 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232638  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3376  helicase-like  69.75 
 
 		 1037 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0409  helicase  70.59 
 
 		 1124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0504  helicase-like  66.93 
 
 		 1140 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.68867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4802  helicase domain-containing protein  67.5 
 
 		 1154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.782354  decreased coverage  0.000173761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1721  helicase domain protein  66.67 
 
 		 1135 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1705  photosynthesis protein modulator  69.83 
 
 		 1003 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000107497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3248  helicase domain protein  68.07 
 
 		 1139 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.916633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4347  ATP-dependent helicase  65.38 
 
 		 1047 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5700  helicase domain protein  65.6 
 
 		 793 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.660496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3817  helicase domain protein  66.39 
 
 		 1087 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3115  helicase domain-containing protein  64.89 
 
 		 1026 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4857  helicase domain protein  66.67 
 
 		 1136 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526105  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4904  helicase domain protein  66.67 
 
 		 1138 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.891527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0492  helicase domain protein  66.39 
 
 		 1093 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  66.67 
 
 		 1140 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7546  putative ATP-dependent RNA and DNA helicase  65.32 
 
 		 1177 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4146  helicase domain protein  66.39 
 
 		 1082 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139556  normal  0.136367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2639  helicase domain-containing protein  66.67 
 
 		 1101 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0121  helicase-like  62.4 
 
 		 855 aa  163  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0074  helicase domain-containing protein  63.87 
 
 		 1142 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313294  normal  0.416773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0281  helicase-like  63.85 
 
 		 1119 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.288418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0548  helicase  63.85 
 
 		 1145 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2422  putative ATP-dependent helicase, MgpS  67.65 
 
 		 930 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3705  helicase domain-containing protein  62.38 
 
 		 1081 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.402139 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36409  predicted protein  39.68 
 
 		 471 aa  78.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.306312  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31704  mitochondrial RNA helicase  36.36 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0436  helicase domain protein  39.53 
 
 		 815 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0437206  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04723  mitochondrial ATP-dependent RNA helicase Suv3, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10820)  41.46 
 
 		 832 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0229389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0710  helicase domain protein  37.86 
 
 		 778 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2285  helicase domain protein  38.94 
 
 		 550 aa  67.8  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4414  helicase domain-containing protein  37.86 
 
 		 714 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2359  helicase domain-containing protein  37.86 
 
 		 585 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2066  helicase domain-containing protein  37.86 
 
 		 585 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06190  RNA helicase like protein, putative  35.94 
 
 		 828 aa  65.1  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0938  helicase domain-containing protein  33.63 
 
 		 789 aa  64.3  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0811  helicase domain-containing protein  36.89 
 
 		 714 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0754  helicase domain protein  36.89 
 
 		 714 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10251  predicted protein  39.81 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0349969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1967  helicase-like  36.07 
 
 		 932 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2996  helicase domain-containing protein  35.19 
 
 		 757 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.21 
 
 		 843 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 708 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  27.69 
 
 		 908 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.14 
 
 		 709 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  30 
 
 		 961 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.69 
 
 		 908 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  27.69 
 
 		 908 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  27.69 
 
 		 908 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  29.17 
 
 		 972 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>