More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2933 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2933  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1024    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  28.14 
 
 		 556 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28 
 
 		 558 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  27.87 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  33.59 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.16 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.25 
 
 		 558 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.74 
 
 		 557 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.48 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.71 
 
 		 559 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 544 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  26.33 
 
 		 558 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  29.89 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.64 
 
 		 559 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  31.43 
 
 		 556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  27.5 
 
 		 550 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.01 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  27.88 
 
 		 565 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  32.19 
 
 		 652 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.13 
 
 		 558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  30.58 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  34.59 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.13 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.51 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.1 
 
 		 573 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.53 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  27.94 
 
 		 591 aa  161  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  27.95 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  25.77 
 
 		 558 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  30.03 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  33.43 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.42 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  29.32 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  27.96 
 
 		 616 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  27.61 
 
 		 556 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.79 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  32.64 
 
 		 582 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5644  ABC-1 domain protein  31.2 
 
 		 646 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588147  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.52 
 
 		 554 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  33.84 
 
 		 582 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  25.41 
 
 		 549 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  35.66 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.58 
 
 		 559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  26 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  29.23 
 
 		 556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.68 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.63 
 
 		 581 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  25.2 
 
 		 549 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  31.41 
 
 		 547 aa  153  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  30.75 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  32.4 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  26.28 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  31.07 
 
 		 583 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  26.78 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  24.32 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.03 
 
 		 530 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  24.13 
 
 		 537 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  27.81 
 
 		 560 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  31.46 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  27.96 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  30.37 
 
 		 550 aa  150  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  32.84 
 
 		 588 aa  150  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.14 
 
 		 525 aa  150  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 547 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  28.3 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  27.34 
 
 		 618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  35.32 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.27 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.5 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.68 
 
 		 568 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  27.11 
 
 		 619 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.79 
 
 		 509 aa  147  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 		 572 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 		 572 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  26.46 
 
 		 618 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.51 
 
 		 559 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  26.22 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.55 
 
 		 558 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.61 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.91 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.27 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  26.46 
 
 		 618 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3101  ABC-1 domain protein  31.3 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  35.32 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  30.79 
 
 		 542 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.14 
 
 		 563 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  23.97 
 
 		 525 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  30.16 
 
 		 567 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  29.64 
 
 		 574 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  26.87 
 
 		 619 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  25.24 
 
 		 571 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2723  ABC-1 domain protein  28.53 
 
 		 464 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232174  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0975  hypothetical protein  34.2 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  32.26 
 
 		 610 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 		 526 aa  143  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>