25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1436 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  30.86 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  32.68 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  31.36 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  32.03 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  32.77 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  31.46 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  34.85 
 
 
238 aa  79  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  33.88 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.23 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  35.94 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  35.23 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  31.21 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  35.61 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  32.89 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  32.69 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  29.49 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  30.13 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  28.46 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  30.09 
 
 
325 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  29.06 
 
 
219 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  30.2 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  24.78 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>