46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0056 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  95.92 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.036867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0017  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_662  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.927512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0052  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>