12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_662 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.036867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_662  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.927512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>