25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3390 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  783    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  60 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  63.44 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  34.33 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  35.09 
 
 		 332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  33.53 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  31.86 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  26.93 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  31.86 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  31.48 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.56 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  25.94 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  27.22 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  27.98 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  25.87 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  28.72 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  27.87 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  25.56 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  20.19 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.56 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  23.64 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  25.08 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  24.03 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>