15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0897 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
291 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  34.6 
 
 
318 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  35.08 
 
 
313 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4651  putative transmembrane anti-sigma factor  33.56 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.202977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.08 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  28.72 
 
 
258 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  27.88 
 
 
246 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  26.24 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  24.82 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0939  putative transmembrane anti-sigma factor  35.24 
 
 
220 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  24.78 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.5 
 
 
255 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  29.45 
 
 
210 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  34.41 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  31.48 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>