55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1216 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  70.59 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  70.09 
 
 		 121 aa  174  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  38.05 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  32.2 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  32.43 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  30.25 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  34.51 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  34.86 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  29.17 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  34.55 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  35.4 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  35.29 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  35.35 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  30.97 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  31.67 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3852  hypothetical protein  29.06 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000776129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  25 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  30.83 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  31.67 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0568  hypothetical protein  32.98 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000883944  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  27.43 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  28.57 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  30.91 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  29.27 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  25.21 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1320  DsrE family protein  28.33 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  31.53 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  29.17 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  29.17 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  23.33 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  27.05 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  29.06 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  28.83 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  31.71 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  31.71 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  28.57 
 
 		 271 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  28.57 
 
 		 271 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  28.07 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  28.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  27.62 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  20.51 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4159  DsrE family protein  29.41 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.126919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  28.93 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  30.3 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  28.93 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  28.93 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  29.75 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  29.75 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>