23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2209 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  76.92 
 
 		 135 aa  214  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  63.91 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  63.91 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  43.2 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  43.2 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  42.96 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  34.96 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  34.96 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  36.13 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  39.13 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  34.88 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  37.8 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  32 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  28.46 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  30.25 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  31.4 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  30.68 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  30.68 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  26.83 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  27.05 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  32.47 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>