24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0696 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  52.05 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  53.42 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  50.68 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  49.32 
 
 
89 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  49.32 
 
 
75 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  51.39 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  51.32 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  48.61 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  51.39 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  48.61 
 
 
74 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  48.61 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  45.07 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  54.05 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  44.93 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  47.06 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  40.28 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  44.12 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  43.59 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  38.96 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  47.73 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  35.21 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>