More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0346 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  76.96 
 
 		 691 aa  1156    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  74.89 
 
 		 690 aa  1118    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  100 
 
 		 691 aa  1423    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  74.67 
 
 		 690 aa  1100    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  78.58 
 
 		 691 aa  1166    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  75.76 
 
 		 691 aa  1146    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  74.71 
 
 		 693 aa  1109    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  44.03 
 
 		 695 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  42.86 
 
 		 679 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.02 
 
 		 695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  42.71 
 
 		 707 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.24 
 
 		 692 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  39.48 
 
 		 694 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  42.3 
 
 		 694 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  40.57 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  39.62 
 
 		 697 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.65 
 
 		 694 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  41.64 
 
 		 673 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.85 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  37.92 
 
 		 694 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  38.43 
 
 		 697 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38.3 
 
 		 701 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  39.45 
 
 		 682 aa  524  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  39.77 
 
 		 680 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  38.72 
 
 		 699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  37.83 
 
 		 696 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38.64 
 
 		 696 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  38.74 
 
 		 701 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  38.51 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  38.61 
 
 		 696 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  38.24 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.63 
 
 		 667 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  38.41 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  38.47 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.52 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  38.69 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  37.94 
 
 		 692 aa  502  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  37.97 
 
 		 688 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.81 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  37.16 
 
 		 693 aa  499  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  37.67 
 
 		 693 aa  500  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  36.7 
 
 		 697 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  36.87 
 
 		 701 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  36.79 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  38.1 
 
 		 697 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  37.02 
 
 		 701 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  36.19 
 
 		 697 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  37.35 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  35.61 
 
 		 719 aa  492  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  38.48 
 
 		 682 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  37.55 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  36.92 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  36.86 
 
 		 691 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  36.65 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  489  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  35.96 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  37.73 
 
 		 697 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  37.21 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  37.06 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  35.96 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  36.39 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  36.32 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  36.26 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.76 
 
 		 692 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.17 
 
 		 689 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  35.82 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  37.9 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  35.89 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  36.14 
 
 		 692 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  35.82 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  36.44 
 
 		 696 aa  480  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  37.83 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.14 
 
 		 703 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  35.94 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  36.07 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  34.86 
 
 		 693 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  37.26 
 
 		 697 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  35.79 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  35.93 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  36.59 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  36.03 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  35.57 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  35.93 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  36.38 
 
 		 694 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  35.44 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  35.13 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  34.63 
 
 		 698 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  36.31 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  36.12 
 
 		 692 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  35.42 
 
 		 697 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  35.45 
 
 		 697 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  36.27 
 
 		 689 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  35.7 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>