20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7462 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7462  PKD domain containing protein  100 
 
 		 975 aa  1921    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0976  hypothetical protein  47.41 
 
 		 394 aa  110  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.794679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  46.24 
 
 		 562 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.08 
 
 		 386 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  40.24 
 
 		 943 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  38.71 
 
 		 1565 aa  49.7  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  44.62 
 
 		 552 aa  48.9  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  28.28 
 
 		 258 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41.25 
 
 		 2066 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  31.08 
 
 		 677 aa  47.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0079  CHAP domain containing protein  30.3 
 
 		 228 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  29.55 
 
 		 960 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  29.55 
 
 		 960 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  35.11 
 
 		 1143 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.36 
 
 		 835 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 		 835 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  31.68 
 
 		 818 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  36.76 
 
 		 669 aa  44.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  43.1 
 
 		 971 aa  44.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 884 aa  44.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>