17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6397 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 612 aa  1226    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  33.42 
 
 		 423 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  29.08 
 
 		 440 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 433 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  24.56 
 
 		 1197 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  22.1 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  25.66 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  25.47 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  20.98 
 
 		 1297 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  23.13 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 129 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 490 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  23.91 
 
 		 719 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>