18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4382 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  100 
 
 		 490 aa  989    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  77.96 
 
 		 476 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  37.6 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  32.78 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  34.04 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  27.95 
 
 		 1034 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  26.49 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  26.42 
 
 		 1157 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  29.49 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  23.85 
 
 		 1167 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  25.84 
 
 		 1053 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  22.27 
 
 		 1057 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  26.64 
 
 		 1073 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  25.11 
 
 		 845 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  21.84 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  24.23 
 
 		 804 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  27.42 
 
 		 980 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 		 1104 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>