13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1232 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383177  hitchhiker  0.00088208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2814  hypothetical protein  71.74 
 
 		 321 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3061  hypothetical protein  43.04 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0080217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4497  hypothetical protein  42.86 
 
 		 320 aa  201  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354512  normal  0.0165777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2043  hypothetical protein  33.75 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0348326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2141  hypothetical protein  28.51 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2719  hypothetical protein  25.96 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3299  hypothetical protein  23.29 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0575  hypothetical protein  27.64 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2142  hypothetical protein  23.17 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 		 576 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2720  hypothetical protein  27.86 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.198238  normal  0.55078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1831  hypothetical protein  35.56 
 
 		 477 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>