21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4861 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4861  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3993  hypothetical protein  63.13 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4382  hypothetical protein  59.78 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2520  hypothetical protein  61.24 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3574  hypothetical protein  52.97 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3558  hypothetical protein  52.15 
 
 		 203 aa  201  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00303  hypothetical protein  49.44 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1347  hypothetical protein  48.11 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0272  hypothetical protein  44.9 
 
 		 215 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1929  hypothetical protein  42.72 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2669  hypothetical protein  43.65 
 
 		 214 aa  160  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30990  hypothetical protein  32.06 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000727395  unclonable  3.33317e-22 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0739  hypothetical protein  31.73 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1771  hypothetical protein  32.66 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9978  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3965  hypothetical protein  29.05 
 
 		 230 aa  97.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5615  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2239  hypothetical protein  27.18 
 
 		 226 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000870146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  26.85 
 
 		 233 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2952  hypothetical protein  31.82 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5163  hypothetical protein  28.3 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1805  hypothetical protein  34.02 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>