17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2704 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  999    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  49.27 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  47.75 
 
 		 304 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  45.18 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  48.04 
 
 		 326 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  40.16 
 
 		 299 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  36.82 
 
 		 231 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  36.07 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  36.07 
 
 		 517 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  35.71 
 
 		 546 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  35.25 
 
 		 510 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  38.64 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  27.38 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  29.29 
 
 		 420 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2476  hypothetical protein  32.73 
 
 		 232 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.324767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  27.74 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  27.2 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>