18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0022 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  597  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  98.63 
 
 		 293 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  42.09 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  40.14 
 
 		 317 aa  228  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  40.97 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  36.63 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  28.86 
 
 		 360 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  23.36 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  26.12 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  26.15 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  26.36 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  26.58 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  24.9 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  26.41 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  25.11 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  24.91 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1083  metallophosphoesterase  23.27 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0304691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  25.86 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>