57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2262 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  97.82 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  37.99 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  36.56 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  37.81 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  41.2 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  32.62 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  38.86 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  34.33 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  31.09 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  37.2 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  32.61 
 
 		 234 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  31.6 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  28.64 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  32.05 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  32.99 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  31.09 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  34.5 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  33.62 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  31 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  32.17 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  38.24 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  30.69 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  28.26 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  31.44 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  28.26 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  33.54 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  29.24 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  33.85 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  35 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  27.95 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  28.14 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  30.09 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  31.47 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  29.57 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  29.65 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  30.9 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  30.9 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  28.82 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  24.88 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  24.86 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  25.41 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  25.15 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  23.56 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  28.32 
 
 		 283 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>