25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1677 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  292  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  96.58 
 
 
146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  35.79 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  33.58 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0809  AIG2 family protein  26.62 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  26.53 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  34.09 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  37.33 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0347  AIG2 family protein  24.82 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  33.65 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  33.65 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  28.37 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  29.77 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  30.6 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  24 
 
 
193 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  21.92 
 
 
174 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  22 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1921  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.766298  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  22.45 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  25.18 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  23.6 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  20.55 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  31.48 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  34.81 
 
 
276 aa  40  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>