34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN02050 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN02030    92.52 
 
 
4377 bp  4250    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01290    96.5 
 
 
2966 bp  868    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    94.69 
 
 
12126 bp  4768    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    87.34 
 
 
825 bp  704    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    92.46 
 
 
4713 bp  4226    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    86.09 
 
 
7155 bp  1156    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    96.34 
 
 
4911 bp  4298    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    98.53 
 
 
5775 bp  6583    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    100 
 
 
3573 bp  7083    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    96.43 
 
 
1743 bp  944    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    92.3 
 
 
4734 bp  3295    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    94.82 
 
 
3126 bp  1518    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    97.02 
 
 
4542 bp  4335    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    93.93 
 
 
7164 bp  4890    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    92.1 
 
 
11454 bp  3376    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    95.08 
 
 
4674 bp  2555    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    96.93 
 
 
1830 bp  3176    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    84.33 
 
 
1383 bp  595  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00510    100 
 
 
5559 bp  204  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    97.98 
 
 
1755 bp  180  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    97.98 
 
 
2895 bp  180  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    97 
 
 
7383 bp  174  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    96.12 
 
 
7809 bp  172  5e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    96.12 
 
 
3186 bp  172  5e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    96.04 
 
 
5844 bp  168  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02530  hypothetical protein  81.98 
 
 
1581 bp  123  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.857331  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    83.97 
 
 
6336 bp  93.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    83.97 
 
 
12648 bp  93.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    83.97 
 
 
6462 bp  93.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    83.97 
 
 
3657 bp  93.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    83.97 
 
 
10638 bp  93.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    83.21 
 
 
5637 bp  85.7  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    83.21 
 
 
5499 bp  85.7  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    95.45 
 
 
2400 bp  63.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>