35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00530 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00530    100 
 
 
4734 bp  9384    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    98.14 
 
 
4713 bp  7590    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    85.46 
 
 
7155 bp  827    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    95.53 
 
 
4911 bp  7466    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    92.57 
 
 
5775 bp  3445    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    92.3 
 
 
3573 bp  3295    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    98.02 
 
 
4377 bp  6928    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    96.16 
 
 
5844 bp  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    96.04 
 
 
1743 bp  690    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    99.29 
 
 
3126 bp  3003    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    97.34 
 
 
7164 bp  4387    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    95.27 
 
 
7809 bp  696    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    96.5 
 
 
1755 bp  722    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    97.87 
 
 
4674 bp  5448    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    96.05 
 
 
1830 bp  2958    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    97.13 
 
 
12126 bp  8066    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    94.37 
 
 
4542 bp  3651    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    97.21 
 
 
7383 bp  987    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    97.98 
 
 
11454 bp  8375    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00510    97.78 
 
 
5559 bp  3065    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    95.35 
 
 
2400 bp  599  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    83.53 
 
 
1383 bp  513  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    95.73 
 
 
3186 bp  385  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    82.94 
 
 
825 bp  343  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    89.55 
 
 
2895 bp  232  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02530  hypothetical protein  82.06 
 
 
1581 bp  147  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.857331  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    79.14 
 
 
6462 bp  115  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    78.86 
 
 
6336 bp  107  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    78.86 
 
 
3657 bp  107  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    78.86 
 
 
10638 bp  107  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    78.86 
 
 
5499 bp  107  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    78.57 
 
 
12648 bp  99.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    77.57 
 
 
5637 bp  85.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01290    82.68 
 
 
2966 bp  69.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    83.13 
 
 
1773 bp  54  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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