43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02780 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB02960    98.2 
 
 
1323 bp  1122    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00543599  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    98.71 
 
 
9432 bp  3921    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    95.96 
 
 
4092 bp  1503    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    96.16 
 
 
5844 bp  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02010    98.79 
 
 
3753 bp  3586    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788594  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02020    98.62 
 
 
2097 bp  3247    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602366  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    96.66 
 
 
5451 bp  1463    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    95.47 
 
 
6690 bp  819    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02940    99.05 
 
 
4674 bp  3985    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0953543  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    96.11 
 
 
1917 bp  981    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02930    97.95 
 
 
5061 bp  2755    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108967  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    97.73 
 
 
4911 bp  779    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    98.72 
 
 
6606 bp  1170    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    96.79 
 
 
6546 bp  1580    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.18 
 
 
4905 bp  1509    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    98.2 
 
 
12126 bp  811    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    95.98 
 
 
12648 bp  1473    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    97.21 
 
 
4734 bp  987    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    96.28 
 
 
1755 bp  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03660    98.11 
 
 
5538 bp  1055    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    96.6 
 
 
7809 bp  733    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    100 
 
 
7383 bp  14640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    98.37 
 
 
11454 bp  3077    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    96.31 
 
 
5544 bp  1570    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    95.44 
 
 
1773 bp  680    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    97.27 
 
 
5811 bp  1584    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00500    98.22 
 
 
1650 bp  2270    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    97.97 
 
 
3126 bp  787    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    94.73 
 
 
7164 bp  718    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  95.19 
 
 
4245 bp  642    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    96.89 
 
 
2400 bp  640  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    98.22 
 
 
4674 bp  414  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    96.09 
 
 
3186 bp  377  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    96.38 
 
 
5775 bp  351  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    92.72 
 
 
4542 bp  260  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    96.32 
 
 
2895 bp  230  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    97.32 
 
 
10638 bp  198  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    97 
 
 
3573 bp  174  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    88.46 
 
 
6462 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    88.46 
 
 
3063 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01280    100 
 
 
1829 bp  54  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    85.96 
 
 
579 bp  50.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    86.79 
 
 
1707 bp  50.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
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