24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01740 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01740  expressed protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07847  LysM domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03980)  28.15 
 
 
646 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.352183 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00511  hypothetical protein  31.86 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  33.64 
 
 
307 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09389  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
589 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  0.0327023 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08466  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
289 aa  55.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03977  hypothetical protein  28.87 
 
 
379 aa  50.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0389554  normal  0.18101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  30.43 
 
 
264 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06664  hypothetical protein  27.66 
 
 
450 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.919915  normal  0.574079 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00543  hypothetical protein  28.46 
 
 
545 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  29.52 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.25 
 
 
335 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00542  hypothetical protein  22.93 
 
 
548 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15431  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10104  hypothetical protein  24.46 
 
 
544 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627759  normal  0.0282221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  28.04 
 
 
301 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
1380 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487463 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  30 
 
 
426 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1380 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 
423 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  26.85 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  28.7 
 
 
297 aa  41.2  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  27.1 
 
 
267 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  27.42 
 
 
423 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>