28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01770 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  884    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  32.08 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  28.5 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  27.78 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  27.16 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  25.91 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  23.64 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  26.58 
 
 
318 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  33.16 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  25.76 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  27.25 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  24.8 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  23.43 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  33 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  27.39 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  26.33 
 
 
305 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  32.77 
 
 
306 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  28.19 
 
 
320 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  34.18 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
273 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  46 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  22.89 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  32.56 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.87 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>