More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00170 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE00170  cobalamin synthesis protein, putative  100 
 
 		 563 aa  1163    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.488231  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10344  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02620)  51.31 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000558186  normal  0.183792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  39.39 
 
 		 402 aa  323  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  39.6 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  38.25 
 
 		 402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  38.34 
 
 		 403 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.35 
 
 		 400 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.35 
 
 		 400 aa  300  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  39.15 
 
 		 402 aa  300  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  37.45 
 
 		 423 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  37.45 
 
 		 423 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  37.45 
 
 		 423 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  38.32 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  48.16 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 416 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  35.8 
 
 		 403 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.99 
 
 		 402 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  46.65 
 
 		 406 aa  276  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  36.01 
 
 		 401 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  37.24 
 
 		 403 aa  276  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  46.01 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  47.53 
 
 		 406 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  36.75 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  37.19 
 
 		 401 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  44.48 
 
 		 423 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  36.93 
 
 		 435 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  45.09 
 
 		 402 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  44.92 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  45.54 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  46.77 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  45.54 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  46.15 
 
 		 395 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  44.48 
 
 		 402 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  46.75 
 
 		 408 aa  264  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  44.92 
 
 		 395 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  44.38 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  45.85 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  44.75 
 
 		 401 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  46.86 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  45.54 
 
 		 395 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  36.99 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.17 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  45.68 
 
 		 423 aa  262  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  44.04 
 
 		 401 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  43.21 
 
 		 415 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  45.07 
 
 		 407 aa  261  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  43.87 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  44.17 
 
 		 402 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  45.54 
 
 		 527 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  42.68 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  43.43 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  43.33 
 
 		 422 aa  257  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  43.77 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  44.24 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  44.24 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  43.64 
 
 		 441 aa  253  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  36.64 
 
 		 388 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  44.17 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  43.77 
 
 		 400 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  42.07 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  42.07 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  44.51 
 
 		 400 aa  251  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  43.43 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  43.38 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  46.27 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  40.84 
 
 		 441 aa  250  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  44.51 
 
 		 401 aa  250  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  41.85 
 
 		 470 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.37 
 
 		 519 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  41.85 
 
 		 437 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  41.85 
 
 		 437 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  41.54 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  43.21 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.73 
 
 		 399 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  42.68 
 
 		 397 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  43.96 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  42.52 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  33.94 
 
 		 399 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 406 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  43.93 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  43.52 
 
 		 540 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  41.72 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  40.61 
 
 		 446 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  41.34 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.3 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  44.14 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.3 
 
 		 446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.55 
 
 		 446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  40.06 
 
 		 446 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.76 
 
 		 446 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  43.12 
 
 		 402 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  42.68 
 
 		 407 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  41.99 
 
 		 403 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  33.73 
 
 		 442 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  40.74 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  42.68 
 
 		 394 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  40.55 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  40.43 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>