23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06820 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06820  PRCDNA87, putative  100 
 
 
126 aa  254  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00995827  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10681  60S ribosomal protein L31e (AFU_orthologue; AFUA_6G13250)  60.18 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83357  60S large subunit ribosomal protein  59.82 
 
 
113 aa  130  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27125  predicted protein  58.82 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736977  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17087  Ribosomal protein L31, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  50.93 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106125  hitchhiker  0.0023739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1263  50S ribosomal protein L31e  40.7 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1609  50S ribosomal protein L31e  35.62 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1825  50S ribosomal protein L31e  38.36 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.957131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1479  50S ribosomal protein L31e  47.92 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000475778  hitchhiker  0.000475716 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1663  50S ribosomal protein L31e  36.99 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0473  ribosomal protein L31e  36.49 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1883  50S ribosomal protein L31e  45.83 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3019  50S ribosomal protein L31e  41.67 
 
 
87 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0539  50S ribosomal protein L31e  43.75 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.0000101779  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0457  50S ribosomal protein L31e  34.25 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1233  Ribosomal protein L31e  40 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.547002  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0126  50S ribosomal protein L31e  27.27 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0973421  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1059  50S ribosomal protein L31e  31.82 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0888  50S ribosomal protein L31e  33.33 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1969  50S ribosomal protein L31e  41.67 
 
 
87 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1077  50S ribosomal protein L31e  33.85 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1615  50S ribosomal protein L31e  31.82 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0458  50S ribosomal protein L31e  35.38 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.76449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>