20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1388 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  98.67 
 
 		 150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  96 
 
 		 150 aa  295  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  50 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  40.94 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  42.28 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  37.16 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  41.61 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  36.99 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  33.57 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.24 
 
 		 406 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  28.47 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  26.62 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  30 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  30.43 
 
 		 634 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  32.35 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  24.49 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  30.67 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  24.83 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>