23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3625 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  244  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  45.69 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  45.24 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  42.02 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  49.43 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  42.71 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  43.64 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  39.64 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  42.22 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  36.75 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  37.04 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  38.39 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  37.84 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  34.55 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  34.96 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  32.08 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1063  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  31.19 
 
 
147 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  27.27 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>