40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3050 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2850  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852328  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1748  Methyltransferase type 12  27.45 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5007  Methyltransferase type 12  25.35 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0563553  hitchhiker  0.00499948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0996  methyltransferase type 12  22.42 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0100468  hitchhiker  0.00269187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2224  methyltransferase type 12  27.11 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2347  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193258  hitchhiker  0.00000472141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.36 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3170  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  30.56 
 
 
285 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.85 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
211 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  30.19 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
283 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  20.9 
 
 
312 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.4 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  30.19 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  25.55 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
230 aa  45.1  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.35 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  23.75 
 
 
333 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  29.25 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.91 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  29.25 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  29.25 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  29.25 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  29.25 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  22.5 
 
 
333 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
309 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  30 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1588  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 
224 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.666171  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  26.79 
 
 
303 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  22.6 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  25.76 
 
 
210 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.85 
 
 
220 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.47 
 
 
247 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>