More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2347 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2347  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
229 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193258  hitchhiker  0.00000472141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3170  Methyltransferase type 11  60.93 
 
 
237 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.26 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.93 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.94 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.1 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.07 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.63 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.76 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.87 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.42 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.38 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.57 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.61 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.79 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  26.63 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.03 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  26.63 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.46 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
309 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.14 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.57 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.43 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.64 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.18 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.09 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.48 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.04 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0369  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.97 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0467778  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.95 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.94 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  29.17 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.67 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0346  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.97 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.423606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
310 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.87 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.87 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
275 aa  55.5  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.83 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
199 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.51 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
201 aa  55.1  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.25 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.78 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.46 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.74 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.71 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  29.03 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.56 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.8 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  29.7 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4578  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.22 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30493  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  25.93 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.14 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.07 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  27.87 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.14 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.14 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  29.56 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.53 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4097  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.44 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4465  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.44 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
274 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.49 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.71 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.87 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 
279 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>