17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1692 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  825    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1691  hypothetical protein  48.01 
 
 
406 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  22.1 
 
 
595 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  26.04 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  24.14 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  23.98 
 
 
490 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  24.16 
 
 
485 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  19.81 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  23.42 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  21.87 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  22.22 
 
 
305 aa  53.5  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  23.95 
 
 
739 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  25.33 
 
 
467 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1311  hypothetical protein  19.11 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0023679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0534  cytochrome c family protein  24.56 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
942 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  21.8 
 
 
434 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>