31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1215 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  44.59 
 
 
189 aa  191  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  42.24 
 
 
189 aa  182  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  42.06 
 
 
191 aa  168  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  41.63 
 
 
191 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  41.63 
 
 
191 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 
190 aa  162  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  38.96 
 
 
191 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  38.89 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  59.62 
 
 
189 aa  129  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  34.29 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  33 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0261  putative competence protein F  34.62 
 
 
174 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  25.21 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  28.71 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  45.65 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  41.67 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  39.34 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  26.36 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  51.35 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  51.35 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  47.37 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
299 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  39.34 
 
 
233 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  31.97 
 
 
273 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
308 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>