More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0579 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0788  cysteinyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
459 aa  642    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0413015  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
468 aa  957    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 
464 aa  629  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 
460 aa  625  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1054  cysteinyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 
466 aa  560  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0630  cysteinyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
460 aa  549  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.347477  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0893  cysteinyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
462 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0823  cysteinyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
462 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.449834  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
466 aa  508  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1208  cysteinyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
462 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
485 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
466 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
460 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
466 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
466 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
465 aa  346  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
466 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
465 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
468 aa  342  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
465 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
465 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
465 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
465 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
465 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
465 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
490 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
485 aa  339  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
465 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
493 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 
468 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
479 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
466 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
462 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
465 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
461 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
459 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
455 aa  333  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
465 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
459 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
465 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
485 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
474 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  38.27 
 
 
485 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
485 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
456 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
461 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
485 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
481 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
461 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  40.47 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
472 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
461 aa  326  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
480 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
453 aa  326  6e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
493 aa  326  6e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
459 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
465 aa  326  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
474 aa  325  7e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
463 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
479 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
461 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
461 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
459 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
463 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
461 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
481 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
483 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
459 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
461 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
461 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
466 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
461 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
461 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
461 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
466 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
460 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
454 aa  323  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
456 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
460 aa  323  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
461 aa  323  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 
481 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>