22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1518 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1518  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 293 aa  587  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00160085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  45.18 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  42.18 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0202  hypothetical protein  39.09 
 
 		 329 aa  217  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0127748  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  45.15 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0109  hypothetical protein  40.92 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0149  hypothetical protein  40.92 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000393312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0121  hypothetical protein  41.23 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000688933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.85 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1396  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.29 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  26.62 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  32.17 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  23.04 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  22.13 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  34.25 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0010  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  36.62 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  26.47 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>