28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1458 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  65.96 
 
 
189 aa  236  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  52.66 
 
 
189 aa  206  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  52.11 
 
 
191 aa  197  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  51.58 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  51.58 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  44.59 
 
 
233 aa  191  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
190 aa  186  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  42.33 
 
 
190 aa  150  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  39.36 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 
242 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  25.52 
 
 
230 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
217 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  26.83 
 
 
217 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  27.62 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  22.94 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  22.94 
 
 
242 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  23.56 
 
 
244 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  27.67 
 
 
269 aa  45.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  37.88 
 
 
297 aa  45.1  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
253 aa  44.7  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.2 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  25.13 
 
 
244 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.13 
 
 
234 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  26.7 
 
 
231 aa  41.2  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>