More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1142 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  73.32 
 
 
464 aa  714    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0788  cysteinyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 
459 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0413015  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
460 aa  950    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 
468 aa  625  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1054  cysteinyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
466 aa  578  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0823  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
462 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.449834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0893  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
462 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0630  cysteinyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
460 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.347477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1208  cysteinyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 
462 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
456 aa  358  8e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
459 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
459 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
468 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
459 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
485 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
459 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
459 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
459 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
461 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
456 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
460 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
461 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
461 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
458 aa  345  7e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
459 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
460 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
487 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  39.91 
 
 
461 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
461 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
461 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
456 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
460 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
459 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
461 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
459 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
461 aa  342  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
481 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
462 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
459 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
490 aa  340  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
459 aa  339  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
494 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
465 aa  338  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
479 aa  336  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
459 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  38.34 
 
 
485 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
462 aa  335  9e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
468 aa  335  9e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
465 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
466 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
461 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
480 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
461 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
485 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
470 aa  333  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
465 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
493 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
468 aa  331  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
493 aa  330  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
500 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
481 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
465 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
465 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
465 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
465 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
465 aa  329  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
465 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
472 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>