22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0948 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0948  ATPase  100 
 
 
109 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.789039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  34.72 
 
 
415 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  34.72 
 
 
415 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  32.1 
 
 
418 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  34.78 
 
 
454 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  31.88 
 
 
416 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  34.62 
 
 
412 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  49.09 
 
 
339 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  32.05 
 
 
412 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  30 
 
 
424 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  30.77 
 
 
407 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  27.27 
 
 
416 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  27.38 
 
 
412 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  34.29 
 
 
424 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  28.99 
 
 
417 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  32.31 
 
 
430 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  32.84 
 
 
425 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  32.89 
 
 
415 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  30.12 
 
 
426 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  31.43 
 
 
408 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.57 
 
 
423 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>